Gene Dmel\Pi3K92E
| General Information | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Symbol | Dmel\Pi3K92E | Species | D. melanogaster | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Name | Pi3K92E | Annotation symbol | CG4141 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Feature type | protein_coding_gene | FlyBase ID | FBgn0015279 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Created / Updated | 2003-12-01/2003-12-01 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genomic Location | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chromosome (arm) | 3R | Recombination map | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cytogenetic map | 92F3-92F3 | Sequence location | 3R:16,454,694..16,460,430 [-] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Map ( GBrowse ) |
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Summary Information
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Automatically generated summary
See sections below for more information | This gene is referred to in FlyBase by the symbol Pi3K92E (CG4141, FBgn0015279). It has the cytological map location 92F3. Its sequence location is 3R:16454694..16460430. Its molecular function is described by 1-phosphatidylinositol-3-kinase activity; phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase activity; phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase activity; phosphoinositide 3-kinase activity; binding. It is involved in the biological processes described with 22 unique terms, many of which group under: regulation of biological process; anatomical structure development; larval development; regulation of cell size; phosphorus metabolic process; instar larval development; positive regulation of biological process; cell growth; phospholipid metabolic process; transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway; larval feeding behavior; gland morphogenesis; autophagy; second-messenger-mediated signaling; response to chemical stimulus. 19 alleles are reported. The phenotypes of these alleles are annotated with 26 unique terms, many of which group under: organ system; anatomical structure; peripheral nervous system; adult segment; nervous system; imaginal precursor; adult; adult mesothoracic segment; cytoplasmic part; thoracic segment. It has 2 annotated transcripts and 2 annotated polypeptides. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| External Summaries | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Detailed Mapping Data
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| FlyBase Computed Cytological Location | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cytogenetic map Evidence for location 92F3-92F3
Limits computationally determined from genome sequence between P{PZ}l(3)1058510585 and P{EP}SyndEP409
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| Experimentally Determined Cytological Location | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cytogenetic map Notes References 92E12-92E13 92E12-92E13 (determined by in situ hybridisation)
92E12-92E13 (determined by in situ hybridisation)
92D-92D (determined by in situ hybridisation)
92D1-92D4 (determined by in situ hybridisation)
92E-92E | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimentally Determined Recombination Data | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Location | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Left of (cM) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Right of (cM) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Notes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Map Data | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Order (in direction of increasing cytology)
References In direction of increasing cytology: anon-92Ea? anon-92Eb? anon-92Ec? H+ Pi3K92E? In direction of increasing cytology: H+ Pi3K92E- Gene Order (overall orientation not stated) References | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Model & Products
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Please see the
GBrowse view of
Dmel\Pi3K92E
for information on other features
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| Comments on Gene Model | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DGC2 data: check structure of 3' exon. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcript Data
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| Annotated Transcripts | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Name FlyBase ID RefSeq ID Length (nt) Associated CDS (aa) FBtr0083940
4396
1088 FBtr0083941
4323
1088 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Additional Transcript Data & Comments | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Reported size (kB) | 3.712 (compiled cDNA) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Comments | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| External Data | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Crossreferences | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polypeptide Data
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| Annotated Polypeptides | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Name FlyBase ID
Predicted MW (kD)
Length (aa)
Theoretical pI
RefSeq ID
GenBank protein
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| Additional Polypeptide Data & Comments | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Reported size (kD) | 1088 (aa); 127 (kD predicted) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Comments | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| External Data | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Linkouts | PANTHER
- Protein classification by function, families, and pathways
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| Crossreferences | InterPro
domains - A database of protein families, domains, and functional sites
• Phosphoinositide 3-kinase, ras-binding (IPR000341)
Phosphatidylinositol 3- and 4-kinase, catalytic (IPR000403)
Phosphoinositide 3-kinase accessory region PIK (IPR001263)
Phosphoinositide 3-kinase, C2 (IPR002420)
Phosphatidylinositol 3-kinase, p85-binding (IPR003113)
C2 calcium/lipid-binding region, CaLB (IPR008973)
Protein kinase-like (IPR011009)
Phosphatidylinositol Kinase (IPR015433)
Armadillo-type fold (IPR016024)
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Sequences Consistent with the Gene Model
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| DDBJ
/
EMBL / GenBank | DNA sequence Protein sequence Name | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UniProtKB/Swiss-Prot | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UniProtKB/TrEMBL | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Maps to | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Does NOT map to | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Identified with | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mapped Features & Mutations
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Please see
GBrowse
or insertion reports for information on insertions of transgenic
constructs and features not listed here
Type Symbol & Location Additional Notes References rescue fragment Pi3K92E[+t14.7] 3R:16,451,399..16,464,293 comment=Position of restriction fragment on reference sequence inferred by FlyBase curator. evidence=experimental linked_to=BamHI-BamHI_rfrag | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External Data
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| Linkouts | DEDB
- Drosophila exon database: splicing graphs
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| Crossreferences | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expression Data
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| FlyBase-Curated Data | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Transcript and Protein data | Please see the FlyBase Gene Expression Report for details of gene expression from the literature. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary of Transcript Expression
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Stage Tissue/Position
Reference
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| Marker for | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Subcellular Localization | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CV Term | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary of Polypeptide Expression
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Stage Tissue/Position
Reference
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| Marker for | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Subcellular Localization | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CV Term | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Microarray Data
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Developmental timecourse, Costello et al., 2008 (Original data from Arbeitman et al., 2002)
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External Data & Images
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| Linkouts | FLIGHT
- Cell culture data for RNAi and other high-throughput technologies
FlyAtlas
- Adult expression by tissue, using Affymetrix Dros2 array
GEO (NCBI)
- Gene expression data: microarray and other high-throughput technologies
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Alleles & Phenotypes
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Summary of Allele Phenotypes
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Lethality Allele viable (with Pi3K92E2H1) Other Phenotypes Allele visible, with Scer\GAL4dpp.blk1 small body (with Pi3K92EA) small body (with Pi3K92E2H1) Sterility Allele Phenotype manifest in Allele eye, with Scer\GAL4GMR.PF ommatidium, with Scer\GAL4GMR.PF chaeta, with Scer\GAL4ap-md544 wing, with Scer\GAL4dpp.blk1 wing & cell, with Scer\GAL4dpp.blk1 imaginal disc & cell, with Scer\GAL4Act5C.PP cell surface & nurse cell | somatic clone, with Scer\GAL4Act5C.PP | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Classical Alleles
( 5 ) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| For All Classical Alleles Show | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Alleles Carried on Transgenic Constructs
( 14 ) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| For All Alleles Carried on Transgenic Constructs Show | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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